Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms