Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms