Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms