Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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