Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.2 ms