Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms