Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK4P57078 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms