Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms