Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms