Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms