Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms