Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIP4K2AP48426 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms