Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5CP41229 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5CP41229 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms