Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBRP36941 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms