Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1E1P36543 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms