Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms