Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD12P35452 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms