Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFC1P35251 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms