Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms