Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF4P34130 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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