Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms