Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms