Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMBRP28336 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms