Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCR1P25024 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms