Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GADD45AP24522 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms