Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRBP23467 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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