Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF3P18847 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms