Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRAP18433 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRAP18433 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRAP18433 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRAP18433 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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