Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF888P0CJ79 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms