Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SRPRAP08240 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRPRAP08240 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRPRAP08240 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRPRAP08240 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRPRAP08240 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRPRAP08240 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms