Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOP08100 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOP08100 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOP08100 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHOP08100 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms