Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms