Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPP2O95045 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP2O95045 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms