Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNSO60931 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNSO60931 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNSO60931 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms