Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms