Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms