Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD28O15084 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms