Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms