Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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