Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms