Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL2O00472 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL2O00472 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELL2O00472 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELL2O00472 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELL2O00472 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELL2O00472 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL2O00472 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms