Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN8O00124 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms