Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
J3QR89 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
J3QR89 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms