Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01387J3KSC0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms