Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCER2I3L3R5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCER2I3L3R5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms