Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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