Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms