Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms