Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms