Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC4A6NH21 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms